黄巢不想硬拼，又率军准备进攻润州（镇江市），但这时候，朝廷又调高骈为镇海节度使（冶所在镇江）抵挡起义军。黄巢要保存实力，不想与这个刽子手打仗，就率军再往南攻打杭州。
当时的杭州已是“骈樯二十里，开肆三万室”的兴旺景象，这反映的是繁荣的市井商业。这里属于浙江西道管辖，军事实力并不很强，赫赫有名的钱氏家族也还没掌管杭州、乃至浙江的大权。
这年八月，农民军攻入杭州城，烧毁官府文书档案，没收财货充做军用，并且开仓放粮，老百姓很高兴。西湖美景美不胜收，吸引了这批农民军围观，黑压压的人群肯定挤满了断桥，只可惜还没到下雪时节，断桥残雪的美景他们没欣赏到。
黄巢不是超脱的仙人，他也是俗人一枚，听说杭州的灵隐寺有名气，也准备来烧香许愿。
灵隐寺当然是有来头的，始建于东晋时期，大约是公元326年。此地背靠北高峰，面朝飞来峰，位置很灵光。504年，南北朝时期的梁武帝将佛教奉为国教，大兴土木建寺立塔，灵隐寺经扩建后，香火日渐旺盛。
后来到北周武帝时期，一度宣布废佛，灵隐寺陷入冷落荒寂。隋朝的隋文帝虽然恢复佛教，但大唐的唐武宗又禁佛，灵隐寺难逃噩运，寺庙被毁，僧人遣散，寺庙内烟火又日渐西沉。
当黄巢来的时候，这里的香火不旺，但当地老百姓还是很信的。不知道黄巢在这里抽到了什么签，反正他很快就率军走了，估计高僧指点他的官运在北方吧。
黄巢率农民军又前往越州（绍兴市），并攻破越州，还俘虏了浙东观察使崔璆（qiú）。这个崔璆很有意思，他做了俘虏，但却一直规劝黄巢，希望他弃暗投明为朝廷效力，但黄巢不为所动。
高骈此时的职务是镇海节度使、浙江西道观察处置使，不再担任荆南节度使。高骈派镇海军的将官张璘、梁绩到达浙东，与农民军会战，张璘也是能征善战的主，官军屡战屡胜。在越州城外，双方展开激战，张璘派小股部队吸引农民军追赶，然后趁势截击，农民军伤亡很多，最后不得已撤出越州城。张璘的官军入驻越州。
遇到了张璘这个对手，黄巢也很头疼，农民军在浙江其实也难以大发展，再往东就是东海，没有任何缓冲回旋之地。如果遭遇官军合围，那么农民军只有跳海的份。
黄巢审时度势，准备再往南打入福建境内。从浙江到福建，用船是最好的方式，但农民军哪里会有船。
黄巢不愧是黄巢，他坚信路就在脚下，立即发动农民军走山路，但崇山峻岭连绵无路可走。黄巢身先士卒，在衢州的仙霞岭丛林中开辟山路(江山县南部的仙霞岭)，硬生生的在丛林中打通了从衢州到建州（南平市建瓯县）之间的几百里山路。
建州城里的官军以为有崇山峻岭阻挡，因而防备松懈，当农民军到了建州城下，官军吓得不知所措，以为神兵天降，城池很快被攻破。而农民军犹如猛虎下山，横扫闽中各州县无对手。