十二月，支持唐僖宗的各路军队攻克凤州，满存担任凤州防御使。
此时，朝廷略占优势，枢密使杨复恭趁机向外传出檄文，召募能斩杀朱玫者，许诺将授予邠宁节度使一职作为奖赏，这其实就是悬赏令。
重赏之下必有勇夫。朱玫手下的大将王行瑜，因为与支持唐僖宗的军队交战时屡次失败，他担心被朱玫冶罪，并且又受到悬赏令的诱惑，就与手下的将士们商议，准备临阵倒戈，获得了将士们的支持。
王行瑜率五万兵从凤州突然回到京师长安，由于他带领的是主力，留在长安的朱玫能掌控的兵马并不多。
朱玫得知王行瑜从前线回来，很吃惊，他责问王行瑜：“你难道要谋反吗？”王行瑜说：“我是要诛杀谋反的人。”
王行瑜率军杀死朱玫的几百护卫兵，抓获了朱玫，并将他杀死。
经过此战，长安城再次遭到乱军劫掠，而皇帝李煴与宰相裴澈、郑昌图率领众官二百多人逃到河中投靠王重荣。
这王重荣也不是省油的灯，他见风使舵，派使者假意迎接他们，然后抓住“皇帝”李煴，将其杀死。
裴澈、郑昌图等官员手无缚鸡之力，只好任人宰割，王重荣囚禁了这些高官。
“皇帝”李煴的首级被送给唐僖宗，唐僖宗下令将这个死人废为庶人，李煴在长安做“皇帝”还不到一年。
朝廷兑现承诺，首先任命立功的王行瑜为静难军节度使（即邠宁节度使）。
禁军都将宋文通，因打叛军有功，被封为武定节度使，赐姓名为李茂贞，就是随皇帝的姓。
右卫大将军顾彦朗也因功被封为东川节度使。
杨守亮改任山南西道节度使，他的兄弟杨守宗也担任金商节度使。
秋后算账也来了，朝廷革除西川监军田令孜的官职爵位，把他长期流放到端州。但田令孜依附哥哥陈敬瑄，赖在成都，不去端州。
唐僖宗又下发诏令，把囚禁在岐山县的“伪宰相”萧遘、郑昌图、裴澈等当众处斩。其余接受李煴封赏的官员也很多，但在杜让能的保护下，大部分都免死了。
清除了长安的叛军，唐僖宗准备从兴元（汉中市）返回长安。887年三月，唐僖宗返回长安途中经过凤翔时，凤翔节度使李昌符担心唐僖宗回到长安追究他以前与朱玫攻打圣驾的罪行，于是以长安宫室还没修整完毕为由，请求唐僖宗在凤翔留住。李昌符这样做一方面是想拉近与唐僖宗的关系，一方面也想控制唐僖宗。
唐僖宗对这些地方藩镇的主帅也不敢轻易得罪，就同意暂留凤翔，但留下皇帝对凤翔节度使李昌符并不见得是好事。
到了这年夏天六月，就发生了一件不大不小的事。皇帝的侍卫将官、天威都头杨守立是枢密使杨复恭的养子，他仗势欺人，当有一次与李昌符在路上相遇时，两人都不主动让道，还引发随从军士的互殴。
这事惊动了唐僖宗，他派宦官前来劝解，竟然也无济于事，二人还是谁不服谁。