“皇帝”李煴的首级被送给唐僖宗，唐僖宗下令将这个死人废为庶人，李煴在长安做“皇帝”还不到一年。
朝廷兑现承诺，首先任命立功的王行瑜为静难军节度使（即邠宁节度使）。
神策军的都将宋文通，因担任唐僖宗的护卫将官，抵挡叛军的进攻，被封为武定节度使，赐姓名为李茂贞，就是随皇帝的姓。
右卫大将军顾彦朗也因功被封为东川节度使。
唐僖宗又下发诏令，把囚禁的“伪宰相”郑昌图、裴澈等当众处斩。
清楚了长安的叛军，唐僖宗准备从兴元（汉中市）返回长安。887年三月，唐僖宗返回长安途中经过凤翔时，凤翔节度使李昌符担心唐僖宗回到长安追究他以前与朱玫攻打圣驾的罪行，于是以长安宫室还没修整完毕为由，请求唐僖宗在凤翔留住。李昌符这样做一方面是想拉近与唐僖宗的关系，一方面也想控制唐僖宗。
唐僖宗对这些地方藩镇的主帅也不敢轻易得罪，就同意暂留凤翔，但留下皇帝对凤翔节度使李昌符并不见得是好事。
到了这年夏天，就发生了一件不大不小的事。皇帝的侍卫将官、天威都头杨守立是枢密使杨复恭的养子，他也仗势欺人，当有一次与李昌符在路上相遇时，两人都不主动让道，还引发随从军士的互殴。
这事惊动了唐僖宗，他派宦官前来劝解，竟然也无济于事，二人还是谁不服谁。
李昌符气不打一处来，他心想：“我在这里供你们吃喝，你一个侍卫官竟然不把我放在眼里，就是皇帝我也敢动。”
当天夜晚，李昌符带兵袭击唐僖宗在凤翔的行宫，但没想到的是，这个地头蛇却被被杨守立的禁军击败。
李昌符失败后，知道会引火烧身，皇帝肯定不会再信任他，于是他带领全家及几百军士逃往陇州（陕西陇县），凤翔这个老巢他也不要了。
唐僖宗这次没有善罢甘休，正好可借此机会整冶凤翔的军队，他命令武定节度使李茂贞率军到陇州讨伐李昌符。。
陇州本来是李昌符管辖的区域，陇州刺史薛知筹接纳了他。当李茂贞率禁军前来时，李茂贞劝说刺史交出李昌符，刺史薛知筹知道自己只是一个棋子，根本不可能与朝廷抗衡，而李昌符也气数已尽，于是他就杀了李昌符全家，开城投降。
李茂贞在此次兵变中成为最大的赢家，他就此接管凤翔镇，唐僖宗加封李茂贞为凤翔和陇右节度使。估计此时谁也想不到的是，李茂贞日后翻起了更大的风浪。