朱温得知李克用来了，自然要高规格接待，他在汴州的上源驿，为其摆酒接风。
但是，李克用酒喝多了之后，完全不顾及朱温等汴州守将的感受，开始大肆炫耀自己的功劳，当汴州的将官表示疑问时，他大发脾气，这惹怒了朱温。
朱温也是有野心的，他也知道李克用将是自己今后最大的竞争对手。此时的朱温也是火往上撞，但他仍然不动声色，继续催李克用喝酒，把他们都灌醉。
晚上，朱温命令军士用木柴堆积在李克用的住处四周，然后火烧李克用的住地。火光冲天之下，李克用的部下发现正身处危险之地，赶快叫醒李克用等人逃走。
也该他们的命大，当天竟然下起了大雨，李克用等人趁着大雨翻墙逃走。朱温的人追杀过来，李克用的部将和侍卫拼死抵抗，护送李克用离开，几乎全部被朱温杀死，代北监军陈景思也被杀。
李克用在养子李嗣源等人的护卫下，终于逃出汴州，五月十六日，回到在许州的营地。李克用想带军队前往汴州报仇，他的夫人阻止了他。夫人说：“你此去寻仇能有多大把握，而且还失去了道义，不如就此回去，并向朝廷报告，由朝廷来惩罚朱温。”
李克用觉得有理，就打消了立即复仇的念头，但在心里从此与朱温成为死敌。
李克用到达许州原来的营寨后，军队的粮食已不多，他向忠武军节度使周岌请求粮食援助，但周岌以粮食缺乏为由拒绝了，估计周岌对李克用在此也很忌惮，希望他尽快离开。李克用就率军从陕州渡过黄河回到晋阳，不再讨伐黄巢。
李克用虽然走了，但官军没有放弃追击黄巢。五月二十日（884年），徐州感化军节度使时溥派遣手下将领李师悦带领一万人继续追击黄巢，刚投降他的尚让也一同前往追击。
六月十五日，当他们追至济宁县的瑕丘时，追上了黄巢的军队，双方发生激战，农民军早已是强弩之末，这一战几乎全军覆没。
黄巢继续往前逃走，两天后，黄巢逃到莱芜市西南的狼虎谷襄王村。
黄巢一看，跟随自己的，就是自己的亲兄弟们和外甥林言，其他的军士已经不多了，他不禁老泪纵横。经过近十年的征战，他多次起死回生，但这次可能再也过去不去了，他也心灰意冷了。
黄巢最喜欢外甥林言，他说：“你们跟着我出生入死，才在长安享受两年的福分，今日官军追赶甚急，我没地方去了，你拿着我的首级去向官军自首吧，或许你还可以借此享受一番荣华富贵，也算我对得起我的姐姐啦。”
林言说：“舅舅休要灰心，我们愿意与你东山再起，继续与官军斗下去。”
黄巢没多说什么，夜里，他举剑自杀身亡。几个兄弟见此情形，自知难逃一死，与其被官军羞辱，不如自己了断，于是也都自杀身亡。。
黄巢的外甥林言准备把黄巢等人的首级献给节度使时溥邀功请赏，当走在路上时，遇到博野军。博野军见人头起意，都想邀功，于是又杀了林言，把林言及黄巢等人首级一并献与时溥。
时溥得到这些人头大喜，立即派人进献黄巢等人的首级到成都给唐僖宗，并附上奏表，对自己如何拼死杀敌又吹嘘一番。