能源研发部，负责对能源的开发升级，以目前太阳炉，热核能源引擎，高能电池，米氏核熔炉为主。
特殊开发研究部，负责关于精神力骨架，塞克缪系统，λ-DRIVER这样特殊的系统研究。
这些主要部门之下都有好几个下属部门，相互之间浑然一体互相帮助，又可以进行各自的任务，工作效率也是相当的不错。
除了这些比较重要的之外，什么神经感应，连携控制，结构稳定等等十数个部门也同样被建立了起来，真正将所有的研究机构完全融为了一体，明确了主要分工却又互相穿插，在有效的管理之下研发力量得到了几倍不止的增幅。
而在这些所有部门之上，还有一个更加尖端的部门，特殊技术研究解析部，罗，雷纳德，普恩托基本就是在这个部门进行工作，聚集了四个世界最优秀的技术人员，在其他全部门的协助下，解析着来自于超级系世界的盖塔，解析着那独特的金属生命体机械兽，更要试图弄清楚萧然口中拥有着无线进化可能的盖塔射线。
四个世界的技术人员，开发人员，研究人员也全部被打散，根据擅长的方面给放进了不同的部门，到现在直接变成了一个有着数万人以上的大型研究机构，让数万人变成了萧然身后最有力的技术支撑。
除了关于机械这方面的研究之外，克鲁泽也主导建立起了一个基因研究机构，专注于对基因方面的事项进行开发，就连迪兰达尔也被拉近了这个机构当中，除此之外四个世界之中不少的基因专家也同样被拉了进来。
甚至于克鲁泽不知道从哪里搞来了影印人的技术，直接在那个正在被改造的戴森球的其中一个模块当中，建立起了一个影印人的小型制造工厂，基因研究部虽然也同样进行了一些不能外传的试验，但克鲁泽也同样把持着一条底线没有做的太过火，所以也算是稳步的进行阶段。
在研究的过程里，包括军团的所有参与者，连带着萧然在内都没有逃脱克鲁泽的毒手，每个人至少都被抽走了一管血，除此之外还在全新统合政府的管辖范围之下寻找外星人的血液基因，弄得基因研究所都变成了一个血库了。
在所有人里面，萧然可以说是最轻松的那一个，每个人都每个人的事情在忙，就连雪莉露也受到邀请前往了其他地方举办了好几次演唱会，但萧然在成为A级机师之后，从属性上来看熟练度已经不能在成为继续晋升的主要条件，和其他人进行战斗训练也是毫无意义。
所以也就是领导一下四个领地的发展，东走走西看看，看看这里看看那里，等到有一天回到自己的办公室之中，萧然才猛然察觉到了一个问题。