周文杰坦言，元培学院为学生提供的“自由”，从某种意义上说仍是一种“消极的自由”。“学生们要在完全不明白这专业是怎么回事的情况下，冒着风险去选课程，而且还得判断这些课程能否触及专业核心问题。”尤其对新生们而言，心理压力一下子就上来了。
不久前，北大BBS上的一个帖子“火”了。发帖者称，他提出了延长学制的申请，结果被学校教务处驳回，耽误了他的保研计划。
不久前，北大BBS上的一个帖子“火”了。发帖者称，他提出了延长学制的申请，结果被学校教务处驳回，耽误了他的保研计划。
这名学生是元培10级的吕伟聪，在修完数学专业课程后，他希望能进行数学与计算机学科的交叉学习，因此申请延期。按照元培的教学计划，学生享有弹性学制，可于3至6年间完成本科教育。可学校教务不予延期的理由是，这名学生的毕业学分已修满。
经过协调，吕伟聪的申请最终被批准。但此事在元培内部仍引起后续讨论：元培没有摆脱“双轨制”的麻烦，学院的一些教学制度，在学校层面得不到有效的行政保障。
虽然“双轨制”并没有随着时间推移完全消失，但许崇任表示，元培学院是建立在生源多样化基础上的一种有益于本科教育改良的模式。元培的改革，针对高等教育的两大突出问题：学生过早进入专业学习导致知识面偏窄；大多数学生盲目选择专业，学习后出现落差。
“北大就是要将相同的学生培养成不同的人。”许崇任称，元培为学生们提供了更多的选择机会，它不一定适合所有学生，但有其存在的必要性。”
4、通识课程的边缘化
无论“通识”还是“博雅”，字面上都强调知识广博。中国大学在开展通识教育时，一个常见做法是要求学生选修本专业之外的课程。
北大开设了五大类通选课程，涵盖了数学与自然科学，社会科学，哲学与心理学，历史学，语言学、文学与艺术，学生必须在每类中至少完成一门课程方能毕业。
这种做法部分参考了美国精英大学的课程表，其中最知名的当属芝加哥大学为低年级学生的“核心课程”。
这种做法部分参考了美国精英大学的课程表，其中最知名的当属芝加哥大学为低年级学生的“核心课程”。
核心课程包括人文学科、数学和自然科学、社会科学三大类科目，强调西方古典人文传统、经典阅读和批判性写作，负担重，标准高，绝不是学生可以在专业课程之外稍加努力即可过关的，因此芝大的学生实际在第三年才开始将全部精力放在主修课程上。
相比之下，一个北大学生毕业需要完成140学分，而通选课程仅占16学分，其余的是专业必修课、专业选修课、英语课、政治课。
低年级时学生的大部分精力耗费在专业课程上，到了高年级则忙于实习、找工作、申请海外研究生院和毕业论文，大学的有效教学时间实际上只有三年。
北大老师为通选课投入了相当的热忱和心力，执教通选课的老师不乏国内相关领域的一流学者，但缺乏核心课程这一制度保障，意味着通选课至多是专业课之余的调剂，元培的学生并没有特殊待遇。
一般来说，美国顶尖大学的学生每学期需要完成三到四门课程，但每门课程会附带可观的作业和阅读，而中国大学生的普遍一学期要学习八到十门课程。
中国大学生并不比美国同龄人更努力，课程数目加倍，只能牺牲完成质量，每学期的一两门通识课完全有可能沦为形式主义。
学习任何学科都需要考察知识发展之历史。
5、例如北京大学2001年9月制定并实施“元培计划”。自2002年开始修订了新的教学计划，在全校本科生范围内实行自由选课制度。在课程设置上，除专业必修课、全校必修课、公共选修课之外，设置通选课。通选课包括数学与自然科学、社会科学、哲学与心理学、历史学、语言学与艺术等5个领域的若干课程。本科阶段基本形成“通识教育+宽口径专业教育”课程模式。
复旦大学从2005年新学期开始把全校68个专业整合成人文、法政、经管、自然科学、技术科学、数学、医院等7类，新生在大一先入复旦学院学习，一年后再进入专业院系学习。学院按培养目标重构了课程内容体系，建立了综合教育、文理基础教育与专业教育的课程框架。
清华大学2014年成立的新雅书院，其办学理念和教学方案等，都在极大程度上借鉴了美国自由教育或通识教育模式。
复旦大学从2005年新学期开始把全校68个专业整合成人文、法政、经管、自然科学、技术科学、数学、医院等7类，新生在大一先入复旦学院学习，一年后再进入专业院系学习。学院按培养目标重构了课程内容体系，建立了综合教育、文理基础教育与专业教育的课程框架。
清华大学2014年成立的新雅书院，其办学理念和教学方案等，都在极大程度上借鉴了美国自由教育或通识教育模式。